A napenergia hasznosítás szempontjából kulcsfontosságú a helyes, feladathoz illeszkedö vezérlési rendszer kiválasztása. A berendezés optimális müködése szempontjábol legalább olyan jelentöséggel bír, mint a csúcsminöségü napkollektor. Mivel a napkollektor olyan hőtermelő, melyben mesterséges tűz helyett a nap tüze biztosítja az energiát, a vezérlésnek figyelembe kell venni a napsugárzás kiszámíthatatlan voltát, az időjárás módosító hatásait pl.: Szikrázó napsütés esetén egyik napkollektornak sem okoz gondot 70-80°C-os melegvíz folyamatos előállítása, más a helyzet egy borongós téli napon, amikor csak sejtjük a nap sziluettjét. A helyesen kiválasztott vezérlési rendszer ilyenkor olyan feladatot keres a napkollektornak, melyet a kedvezötlen körülmények ellenére is jó hatásfokkal képes megoldani. Ilyen feladat a padlófűtés közvetlen kiszolgálása, vagy a használati melegvíz előmelegítése, melyhez csak 30-40°C-os hőmérséklet kell.